세금에 대해 완전 문외한이라서요 ..ㅎㅎ

현재 숙박업으로 게하 운영 중인데요 게하 쪽으로 사업자 1개, 주류 판매를 위해서 게하에 딸린 식당 쪽으로 사업자 1개 이렇게 2개 낸 상태에요 

세금 문제 처리 위해서 매입, 매출 되는 것 각각으로 나눠서 카드를 써야 하는 건가요? 

아니면 하나로 해도 상관이 없는 건가요? 

그리고 2개 사업자 합쳐서 기준치 이상 되면 일반 과세로 변환 되는 거겠죠?