배달대행 부가세 세금 계산 어떻게 하시나요? 초보 사장님 질문입니다..ㅜ

이번에 처음 종합소득세랑 부가세 신고 준비하는 초보입니다.. 배달대행업체에 내는 예치금이랑 관리비 같은 거 부가세 계산할 때 비용 처리 다들 어떻게 받으시는지 궁금해요.. 먼저 겪어보신 사장님들 후기나 팁 좀 알려주시면 감사하겠습니다 ㅠ