상가 건물 매입 계약서 쓰려는데 대지권 미등기 관련해서 질문 있습니다

마음에 드는 상가 자리가 나와서 부동산 계약을 앞두고 등기부등본을 뗐는데 건물은 등기가 되어 있는데 대지권 미등기 상태라고 나오네요;; 공인중개사 말로는 분할 절차가 늦어져서 그런 거지 아무 문제 없다고 계약 진행하자는데.. 나중에 경매로 넘어가거나 재산권 행사할 때 대지권 때문에 골치 아파지는 거 아닌가요? 걱정되네요;;