G사 배달 대행 프로그램 쓰는데 매달 정산서에 찍히는 부가세 잉여금 항목 정체가 뭔가요? 세무 질문요

매장에서 배달 대행 업체로 G사 프로그램을 제휴해서 쓰고 있습니다.. 매달 말일에 한 달간 지출된 배달 대행 총 차감 정산 명세서를 팩스로 받아서 세무 대행사 보내주는데 명세서 하단 세부 내역에 부가세 잉여금 이라는 명목으로 매달 몇만원씩 정산 잔액 차감 금액이 잡혀 있더라고요.. G사 고객센터는 전산상 올림 처리 단수 차액이라는데 이 부가세 잉여금 세금 신고할 때 매입세액 공제 처리가 정당하게 가능한 항목인지 질문 올려요..